Обучение проводите, сейчас интегрированные системы управления бизнесом делают максимально простыми в работе, для большинства операций подойдет стандартная инструкция. То есть если смотреть именно с этой стороны, то никаких сложностей. Сложности будут с сотрудниками, которые будут отказываться учиться новому, это есть у них такая фишка. Вот тут советую подумать о штрафных санкциях, чтобы убедить в необходимости обучения.